Zgnilizna szyjki jest pospolitą chorobą okresu pozbiorczego cebuli. Objawy trudno dostrzec podczas wzrostu i zbioru. Już na wschodzącej cebuli może pojawić się nikłe zarodnikowanie na powierzchni resztek okrywy nasiennej. Od wierzchołka zamiera tkanka liścieni, później wierzchołki liści, potem następuje utajona faza rozwoju choroby, aż do zbioru. Najgroźniejsze infekcje występują pod koniec okresu wegetacji cebuli, od momentu załamywania się szczypioru do czasu zbioru cebuli. Infekcja rozprzestrzenia się najczęściej od wierzchołka szyjki oraz uszkodzeń mechanicznych na łuskach zewnętrznych cebuli. W górnej części szyjki cebuli porażona tkanka ciemnieje i gnije. Na zewnętrznej części cebuli może wówczas występować obfity, szary nalot z czarnymi skupieniami. Podczas przechowywania choroba szybko się rozprzestrzenia, wynikiem czego jest masowe gnicie cebuli.